W dniach 28-29 września 2021 r. Katedra Bezpieczeństwa Narodowego Instytutu Nauk Politycznych i Stosunków Międzynarodowych UJ we współpracy z Global Trends Lab POB Society of the Future zorganizowała międzynarodową konferencję online pt. Innovative Security Governance: Interdisciplinary Perspectives. Była to trzecie wydarzenie w cyklu Jagiellonian Interdisciplinary Securty Conference (poprzednie miały miejsce w Krakowie w latach 2015 i 2018).

27 września w ramach obchodów jubileuszu 40-lecia Wydiału Chemii UJ odbyło się uroczyste posiedzenie rady wydziału, podczas którego uhonorowano troje wybitnych chemików związanych z UJ. W Auli Jagiellońskiej Collegium Maius nastąpiło wręczenie srebrnego medalu "Plus Ratio Quam Vis" prof. Krystynie Dyrek oraz odnowienia po pięćdziesięciu latach doktoratów prof. Zofii Stasickiej i prof. Romana Dziembaja.

22 września 2021 w Auli Collegium Novum UJ odbyło się wyjątkowe wydarzenie - spotkanie uczniów szkoły nr 1 im. ks. prof. Józefa Tischnera w Starym Sączu z Panią Bronisławą Horowitz-Karakulską.

W dniach 13-15 września 2021 roku, na Uniwersytecie Jagiellońskim odbyła się międzynarodowa konferencja 4th European Conference on Metal-Organic Frameworks and Porous Polymers (EuroMOF2021), zorganizowana przez Dariusza Matogę, profesora uczelni, który prowadzi badania nad sieciami metalo-organicznymi (MOF) na Wydziale Chemii UJ.*

10 września nastąpiło oficjalne przekazanie obiektu i zbiorów Centrum Edukacji Przyrodniczej UJ dla społeczeństwa. – Bardzo się cieszę, że udało się zrealizować inwestycję, która od dzisiaj będzie służyć nie tylko studentom i naukowcom naszej uczelni, ale również mieszkańcom Krakowa i Małopolski – powiedział podczas uroczystości rektor UJ prof. Jacek Popiel.